Непонятно, кто кому выплачивает?
Непонятно, кто кого ждет. Попробуйте переформулировать.
Непонятно, кто что обжалует.
Непонятно, кто с кем знакомится. Можно написать так:
Знакомьтесь: жених. А это невеста.
Двоякое восприятие вполне возможно. Хотя структура предложений располагает к Вашему варианту прочтения.
Оба варианта неудачны: непонятно, кто кого контролирует (руководство предприятия контролирует рабочую группу? руководство контролирует предприятие рабочей группы? предприятие контролирует руководство рабочей группы?).
Первый вариант неудачен: непонятно, кто кого укусил. А с грамматической точки зрения возможно и так и так.